Description
Technologies du Vivant - 5e année - Semestre 1
UE3 - Biotechnologies
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Cette UE est composée de :
- Automatisation en analyse biologique (2 hC, 4 hTD)
- Techniques microscopiques (6 hC, 7h TD, 3 hTP)
- Aspects physiques des bioréacteurs (10 hC, 3h TP)
- Matériaux bio-compatibles à propriétés contrôlées (10 hC, 10 hTD)
- Conférences (jusqu'à 20h en fonction du nombre des intervenants, variable suivant les années)
Pré-requis obligatoires
Notions générales de physique, de biologie et de chimie.
Bioréacteurs : connaissance des modèles cinétiques des différents modes de cultures en bioréacteur (batch, fed-batch et continu) et transfert d’oxygène dans les bioréacteurs
Contrôle des connaissances
Contrôle continu
Syllabus
Automatisation en analyse biologique
Robotisation
- Utilisation des robots dans le domaine de la recherche biologique, aussi bien académique qu'industrielle.
- Description des dispositifs.
- Mise en situation par la présentation de différents robots de pipetage présents sur la plate-forme PRIMACEN.
Techniques microscopiques
- Microscopie
Cette partie de l’enseignement présente une revue des approches de microscopies optiques et électroniques, ainsi que les différents modes (balayage, confocal, champ clair, champ sombre, filtrage de Fourier, tomographie…) et concepts qui y sont associés (longueurs d’ondes, aberrations, limite de résolution, profondeur de champ...). Les techniques d’imagerie X (radiographie et tomographie), ainsi que d’imagerie nucléaire sont également introduites. Des dispositifs expérimentaux complexes sont présentés aux étudiants. L’accent est mis sur les caractéristiques principales de chaque technique (résolution, résultats pouvant être obtenus, type d’échantillon, difficulté de mise en œuvre).
- Capteurs
La partie « Capteurs » pour l’imagerie biologique vise à expliquer le fonctionnement, le choix et l’utilisation des capteurs en mode plan (CCD, sCMOS) et en mode point (PMT, APD, HyD, …) qui sont des éléments prépondérant dans la détection du signal, en particulier de la fluorescence, pour les différentes modalités de nanoscopie, microscopie, macroscopie et imagerie in vivo. Le cours est illustré par l’utilisation de différents capteurs sur des systèmes de microscopie champ large ou confocale de la Plate-forme de Recherche en IMAgerie CEllulaire de Normandie (PRIMACEN-IBiSA) lors de séance de TP/démonstration.
Aspects physiques des bioréacteurs
- Régulation et contrôle des bioréacteurs
- Différentes géométries des bioréacteurs
- Cas particulier des cytoculteurs
- Problématique de la mise à l’échelle
Description des TP
Présentation des différents types de bio-réacteurs
Matériaux bio-compatibles à propriétés contrôlées
- Généralités biomatériaux (en particulier les enjeux et problèmes à résoudre)
- Techniques de modification de surface de matériaux
- Techniques caractérisation de surfaces de matériaux
- Techniques d’évaluation de certaines propriétés apportées
Informations complémentaires
Mutualisé entre PS5 et TV5
Compétences visées
Automatisation en analyse biologique
- Connaître les technologies associés à des analyses en masse en biologie
Techniques microscopiques
- Connaître les techniques de microscopie et leurs caractéristiques (résolution, mise en œuvre)
- Savoir mettre en lien une technique d’imagerie avec un questionnement scientifique lorsque cela est pertinent.
- Connaître les principales caractéristiques et la criticité des différents rayonnements utilisés en technique d’imagerie.
- Connaître la technologie des capteurs pour l’imagerie
Aspects physiques des bioréacteurs :
- Maîtriser les diverses technologies des bioréacteurs et connaissance de leurs applications en production industrielle
Matériaux bio-compatibles à propriétés contrôlées :
- Connaître et utiliser les outils pour apporter des propriétés spécifiques aux matériaux biocompatibles afin de répondre aux problèmes actuels dans le domaine de la santé liés à leur utilisation
Conférences
- Ouverture vers des domaines non abordés dans les cours, en particulier, présentation d'innovations scientifiques et techniques récentes